More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2332 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  57.17 
 
 		 546 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000133851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1581  phosphoglucomutase  60.18 
 
 		 553 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02553  phosphoglucomutase  54.59 
 
 		 550 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  70.89 
 
 		 550 aa  829    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1922  phosphoglucomutase  69.35 
 
 		 559 aa  806    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0855  phosphoglucomutase  57.17 
 
 		 546 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0156964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  55.58 
 
 		 545 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  57.64 
 
 		 547 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0819  phosphoglucomutase  57.17 
 
 		 546 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00834178  normal  0.142423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  56.44 
 
 		 547 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  68.72 
 
 		 548 aa  805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  70.52 
 
 		 550 aa  828    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2332  phosphoglucomutase  100 
 
 		 551 aa  1139    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90326  hitchhiker  0.000453174 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  70.94 
 
 		 550 aa  832    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  0.00000000164585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  61.78 
 
 		 546 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1985  phosphoglucomutase  65.15 
 
 		 568 aa  773    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  70.94 
 
 		 550 aa  831    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  0.00000535585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  55.9 
 
 		 549 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  57.71 
 
 		 548 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  57.22 
 
 		 553 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  70.58 
 
 		 550 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000239704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  70.34 
 
 		 550 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  70.52 
 
 		 550 aa  821    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  68.97 
 
 		 547 aa  778    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  55.45 
 
 		 549 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  70.34 
 
 		 550 aa  816    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  0.0000149403 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 548 aa  646    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 546 aa  634    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1706  phosphoglucomutase  68.59 
 
 		 560 aa  772    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  60.62 
 
 		 550 aa  689    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  56.83 
 
 		 548 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2275  phosphoglucomutase  78.69 
 
 		 550 aa  898    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00864716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  70.76 
 
 		 550 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  57.17 
 
 		 546 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  70.76 
 
 		 550 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000344179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  56.83 
 
 		 548 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  55.62 
 
 		 547 aa  632  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  53.62 
 
 		 552 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  56.81 
 
 		 547 aa  634  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  57.19 
 
 		 547 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0806  phosphoglucomutase  56.99 
 
 		 546 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000341822  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  56.62 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000381568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  56.62 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2968  phosphoglucomutase  56.62 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00229066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  56.62 
 
 		 546 aa  630  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000485556  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  56.62 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000314178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  56.62 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  56.83 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  56.44 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  56.62 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  54.73 
 
 		 546 aa  626  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  54.81 
 
 		 547 aa  625  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 546 aa  628  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000022067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  53.49 
 
 		 550 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  54.45 
 
 		 550 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  54.89 
 
 		 548 aa  619  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  53.28 
 
 		 545 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  54.63 
 
 		 550 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  54.29 
 
 		 556 aa  619  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  55.17 
 
 		 547 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  53.73 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  55.84 
 
 		 547 aa  617  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01060  phosphoglucomutase  54.34 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  55.01 
 
 		 547 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  54.35 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  52.27 
 
 		 548 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  55.01 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  55.01 
 
 		 547 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  54.53 
 
 		 551 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0902  phosphoglucomutase  51.65 
 
 		 547 aa  609  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  54.07 
 
 		 550 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  53.55 
 
 		 553 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  54 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  54.28 
 
 		 547 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000232571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  54.1 
 
 		 547 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  53.45 
 
 		 547 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  53.68 
 
 		 550 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  52.96 
 
 		 557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1695  phosphoglucomutase  53.66 
 
 		 551 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  54.31 
 
 		 544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  53.2 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  52.99 
 
 		 561 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  52.1 
 
 		 548 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  52.01 
 
 		 550 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  50.89 
 
 		 563 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  53.3 
 
 		 551 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  52.18 
 
 		 545 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  52.44 
 
 		 546 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  53.2 
 
 		 546 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  52.36 
 
 		 551 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13085  phosphoglucomutase  53.79 
 
 		 547 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.794041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  51.92 
 
 		 548 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  52.72 
 
 		 548 aa  593  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  52.18 
 
 		 545 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3191  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  52.66 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.434573  normal  0.0301219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  52.18 
 
 		 559 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  54.07 
 
 		 564 aa  594  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  52.27 
 
 		 549 aa  591  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  52.29 
 
 		 548 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  52.65 
 
 		 550 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>