188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1267 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1267  ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3977  ribosomal protein L30  74.58 
 
 		 59 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 57 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 57 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0472  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291193  hitchhiker  0.00000269713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000122641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0505  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00113735  normal  0.0573997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4731  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000152085  normal  0.600234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5061  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000009319  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  44.07 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0644  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4530  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0070404  normal  0.197222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  50 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3891  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000029695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2354  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  47.46 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  48.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  48.15 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2306  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  46.3 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>