38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3723 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  100 
 
 		 178 aa  373  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  63.52 
 
 		 208 aa  213  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  63.52 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  63.52 
 
 		 189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  64.78 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  61.64 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  61.64 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  47.13 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  46.58 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  37.87 
 
 		 295 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  44.85 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  43.2 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  41.82 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  40 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  39.38 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  36 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  34.86 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  37.79 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  40.61 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  40.61 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  41.57 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  37.28 
 
 		 268 aa  94.4  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  43.8 
 
 		 125 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  32.95 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  32.75 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  34.36 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  34.27 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  27.91 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  28.74 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  31.18 
 
 		 424 aa  67.8  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  30.54 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  29.82 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  28.65 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  29.73 
 
 		 285 aa  50.8  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  26.9 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  27.07 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>