37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1372 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  100 
 
 
268 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  46.06 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  41.38 
 
 
295 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  35 
 
 
177 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  38.46 
 
 
185 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  38.51 
 
 
194 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  37.28 
 
 
178 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  40.83 
 
 
185 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  37.58 
 
 
185 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  38.07 
 
 
181 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  38.36 
 
 
169 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  35.56 
 
 
189 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  36.02 
 
 
167 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  37.27 
 
 
189 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  30.56 
 
 
180 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  37.27 
 
 
208 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  36.31 
 
 
185 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
173 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  38.51 
 
 
184 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  35.4 
 
 
171 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  36.41 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  34.92 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  35.16 
 
 
183 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  28.34 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  37.3 
 
 
125 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  32.26 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  32.39 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  23.56 
 
 
172 aa  62.4  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  27.51 
 
 
202 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
493 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  36.05 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  26.35 
 
 
424 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  28.82 
 
 
187 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  23.63 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
196 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  25.62 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  28.74 
 
 
273 aa  42  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>