38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1922 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  62.36 
 
 
181 aa  233  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  52.72 
 
 
194 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  50 
 
 
185 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  47.98 
 
 
184 aa  144  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  47.75 
 
 
185 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  45.2 
 
 
198 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  44.81 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  44.81 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  44.38 
 
 
173 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  44.97 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  43.45 
 
 
208 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  49.19 
 
 
125 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  42.77 
 
 
189 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  42.17 
 
 
189 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  38.55 
 
 
167 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  41.57 
 
 
178 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  42.77 
 
 
169 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  32.97 
 
 
295 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  30.73 
 
 
177 aa  87.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  36.41 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  34.07 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  30.81 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  31.09 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  31.84 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
493 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  31.02 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  25.86 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  29.53 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  25.99 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  30.29 
 
 
273 aa  54.3  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
424 aa  52  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  29.41 
 
 
285 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  33.73 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>