37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1345 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  100 
 
 
173 aa  351  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  89.44 
 
 
171 aa  295  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  77.11 
 
 
208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  76.65 
 
 
189 aa  263  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  76.65 
 
 
189 aa  262  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  67.26 
 
 
169 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  60.37 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  49.06 
 
 
190 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  48.59 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  45.68 
 
 
194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  45.03 
 
 
198 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  46.47 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  45.29 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  42.35 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  42.94 
 
 
185 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  45.88 
 
 
181 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  37.65 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  44.38 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  36.9 
 
 
295 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  33.91 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  44.72 
 
 
125 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  29.78 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  34.81 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  33.33 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  34.78 
 
 
268 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  32 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  27.38 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  27.37 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  29.14 
 
 
424 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  31.55 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
493 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  26.67 
 
 
285 aa  58.2  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  27.33 
 
 
204 aa  58.2  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>