38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4140 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  41.38 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  39.76 
 
 
190 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  37.87 
 
 
178 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  34.91 
 
 
194 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  37.72 
 
 
171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
208 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  36.53 
 
 
189 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  36.9 
 
 
173 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  32.04 
 
 
177 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  38.64 
 
 
185 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  33.53 
 
 
169 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  36.92 
 
 
185 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  35.47 
 
 
198 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  36.41 
 
 
185 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  35.75 
 
 
184 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  38.07 
 
 
185 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  35.36 
 
 
181 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
186 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
183 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
167 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  29.89 
 
 
184 aa  85.9  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  29.61 
 
 
180 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  37.6 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  34.29 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  28.95 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  31.84 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  22.54 
 
 
172 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  26.9 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  26.39 
 
 
172 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
187 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  25 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
493 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  24.16 
 
 
204 aa  46.2  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  25.27 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  27.96 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>