38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1558 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  100 
 
 
184 aa  373  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  81.42 
 
 
198 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  70.72 
 
 
185 aa  262  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  69.27 
 
 
185 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  69.27 
 
 
185 aa  255  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  69.27 
 
 
185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  56.47 
 
 
181 aa  177  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  51.4 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  49.16 
 
 
194 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  47.98 
 
 
183 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  47.31 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  43.27 
 
 
189 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  43.27 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  45.18 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  45.83 
 
 
169 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  43.18 
 
 
208 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  51.59 
 
 
125 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  41.82 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  38.15 
 
 
167 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  32.4 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  35.75 
 
 
295 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  38.51 
 
 
268 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  31.55 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  35.46 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  28.57 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  36.76 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  30.56 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  26.74 
 
 
172 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  31.07 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  31.5 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  29.21 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
493 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  27.54 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
424 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  32.97 
 
 
285 aa  48.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  28.49 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>