37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1552 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  350  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  27.01 
 
 
183 aa  87.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  28.34 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  29.59 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  32.42 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  31.14 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  27.43 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  30.56 
 
 
285 aa  71.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  26.9 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  27.71 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  28.07 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  28.32 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  31.84 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  27.75 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  32.77 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
424 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  26.01 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
493 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  27.92 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  26.45 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  28.32 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  25.15 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  30.69 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  26.39 
 
 
295 aa  53.9  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  25.62 
 
 
268 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>