38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3216 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  100 
 
 
185 aa  370  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  96.22 
 
 
185 aa  359  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  91.11 
 
 
185 aa  330  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  74.59 
 
 
185 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  70.95 
 
 
198 aa  261  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  69.27 
 
 
184 aa  255  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  48.89 
 
 
194 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  51.98 
 
 
190 aa  168  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  53.53 
 
 
181 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  44.81 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  43.45 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  42.51 
 
 
189 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  43.71 
 
 
171 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  42.51 
 
 
189 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  42.51 
 
 
208 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  57.94 
 
 
125 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  40.72 
 
 
169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  40.61 
 
 
178 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  36.41 
 
 
295 aa  97.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  35.8 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  33.33 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  37.58 
 
 
268 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  29.21 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  32.76 
 
 
183 aa  87.4  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  30.23 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  28.19 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  26.47 
 
 
172 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  27.84 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  32.78 
 
 
273 aa  57.8  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
204 aa  55.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  30.89 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  27.71 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  24.71 
 
 
424 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  24 
 
 
285 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  28.05 
 
 
493 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>