40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5667 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  62.36 
 
 
183 aa  233  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  56 
 
 
194 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  56.47 
 
 
184 aa  177  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  52.94 
 
 
185 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  53.53 
 
 
185 aa  167  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  54.12 
 
 
185 aa  167  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  52.94 
 
 
198 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  56.8 
 
 
185 aa  165  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  51.12 
 
 
190 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  57.46 
 
 
125 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  45.24 
 
 
173 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  45.83 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
189 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  44.64 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  43.64 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  41.48 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  40.61 
 
 
178 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  35.36 
 
 
295 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  32 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  38.07 
 
 
268 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  38.89 
 
 
184 aa  87  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  31.38 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  30.22 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  46.34 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  31.03 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  30.36 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  28.9 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  40.22 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  26.45 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  38.37 
 
 
493 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  23.67 
 
 
172 aa  58.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  28.34 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
424 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  28.9 
 
 
273 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  28.16 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  26.47 
 
 
285 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4142  hypothetical protein  32.67 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3881  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65628  normal  0.50088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>