38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3540 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3540  metallophosphoesterase  100 
 
 
185 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  0.605156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3216  metallophosphoesterase  96.22 
 
 
185 aa  359  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3411  metallophosphoesterase  89.44 
 
 
185 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1365  metallophosphoesterase  72.38 
 
 
185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0614  metallophosphoesterase  69.83 
 
 
198 aa  259  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20629  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1558  metallophosphoesterase  69.27 
 
 
184 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5193  metallophosphoesterase  47.78 
 
 
194 aa  170  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.347641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2507  metallophosphoesterase  51.98 
 
 
190 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5667  metallophosphoesterase  52.94 
 
 
181 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1922  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.611638  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1345  metallophosphoesterase  42.86 
 
 
173 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.594435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0898  metallophosphoesterase  43.11 
 
 
171 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1615  metallophosphoesterase  41.04 
 
 
189 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  hitchhiker  0.00320974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1897  metallophosphoesterase  41.04 
 
 
189 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1621  metallophosphoesterase  41.57 
 
 
208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.312444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0068  metallophosphoesterase  53.97 
 
 
125 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.494721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5395  metallophosphoesterase  39.52 
 
 
169 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3723  metallophosphoesterase  37.79 
 
 
178 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30333  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4140  hypothetical protein  36.92 
 
 
295 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0982  metallophosphoesterase  35.84 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0235375 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0016  metallophosphoesterase  29.21 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25500  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  32.78 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20440  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  33.14 
 
 
183 aa  90.9  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.5474  normal  0.257186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1372  phosphoesterase or phosphohydrolase-like  36.31 
 
 
268 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0784  phosphoesterase or phosphohydrolase  29.65 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3176  metallophosphoesterase  30.9 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.398414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0765  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1871  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000170547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1552  hypothetical protein  27.06 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000398029  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4371  metallophosphoesterase  28.36 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145081 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05520  predicted phosphoesterase or phosphohydrolase  28.65 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1598  metallophosphoesterase  28.11 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0368  metallophosphoesterase  30.89 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.116618  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0663  phosphoesterase/phosphohydrolase  31.67 
 
 
273 aa  56.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0561  phosphoesterase or phosphohydrolase-like protein  27.11 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2517  metallophosphoesterase  24.71 
 
 
424 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0613  phosphoesterase or phosphohydrolase  24 
 
 
285 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1212  metallophosphoesterase  26.83 
 
 
493 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0151714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>