46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5189 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  48.39 
 
 		 289 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  40.07 
 
 		 284 aa  238  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  39.72 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  41.73 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  37.5 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  36.79 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  34.3 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  32.62 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  35.19 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  32.14 
 
 		 283 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  32.04 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.54 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.48 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.94 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  26.29 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  26.29 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  26.29 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  26.29 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  26.29 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  26.29 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  26.29 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.71 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.01 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.12 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  26.7 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.05 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.35 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.08 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  27.32 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3124  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.55 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.025848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.08 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3545  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.11 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00374918  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  28.49 
 
 		 318 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.2 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.817518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2861  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.6 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0246  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.6 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.37 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.14 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.4 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0143  hypothetical protein  25.41 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  38.24 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.44 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.26 
 
 		 316 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3348  BadF/BadG/BcrA/BcrD type ATPase  25.51 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.82 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>