46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6539 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  100 
 
 		 280 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  43.93 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  42.39 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  41.73 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  40.5 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  40 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  38.04 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  39.08 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  38.71 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  33.69 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  32.98 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  32.36 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  36.96 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.33 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  36.36 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  36.36 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  36.36 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  36.36 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  36.36 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.08 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  36.84 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  36.84 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6680  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.31 
 
 		 377 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.36 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.17 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.06 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.29 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.88 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03429  hypothetical protein  30.63 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.96 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.3 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.08 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.26 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.59 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.47 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2861  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.36 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0246  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.36 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.36 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.08 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.04 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.58 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.58 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3348  BadF/BadG/BcrA/BcrD type ATPase  35.06 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.95774 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  33.02 
 
 		 295 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  33.02 
 
 		 295 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1887  N-acetylglucosamine kinase-like protein  29.52 
 
 		 355 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>