35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3064 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  586  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  40.07 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  36.3 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  38.04 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  39.01 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  38.89 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  36.75 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  34.63 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  36.27 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  33.45 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  32.75 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  28.37 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  26.88 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.47 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.86 
 
 		 348 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.47 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.47 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.47 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.47 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.47 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.95 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  27.47 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  27.47 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.5 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  28.02 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.4 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.25 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1887  N-acetylglucosamine kinase-like protein  27.61 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.47 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.42 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  23.11 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.32 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.24 
 
 		 277 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.12 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>