40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3564 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  48.39 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  45.55 
 
 		 283 aa  254  8e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  43.93 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  39.64 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  36.3 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  37.23 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  38.08 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  33.57 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  34.04 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  32.27 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  32.51 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.28 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.4 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3866  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.75 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  26.73 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1674  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.75 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3947  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.75 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3105  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.75 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3445  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  27.75 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2870  hypothetical protein  27.75 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0087  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  27.75 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.09 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  39.78 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  39.78 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.03 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3192  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  29.14 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.09 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.11 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0228  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.08 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.89 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.05 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2907  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.94 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.610469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.09 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.62 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.61 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.16 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.67 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.67 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0124  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.71 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>