21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05120 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  590  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  47.35 
 
 
284 aa  265  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  47.9 
 
 
283 aa  258  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  39.08 
 
 
280 aa  192  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  32.74 
 
 
284 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  35.19 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  34.04 
 
 
289 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  35.54 
 
 
286 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  37.72 
 
 
283 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  32.51 
 
 
279 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  32.75 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  28.42 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  22.35 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.17 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.11 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.4 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.67 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.97 
 
 
286 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.75 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1855  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.67 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.591681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1887  N-acetylglucosamine kinase-like protein  27.5 
 
 
355 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>