14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1626 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  590  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  53.57 
 
 
283 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  47.35 
 
 
286 aa  265  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  35.82 
 
 
284 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  33.57 
 
 
289 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  32.62 
 
 
281 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  34.63 
 
 
284 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  33.22 
 
 
286 aa  175  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  32.98 
 
 
280 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  32.07 
 
 
283 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  32.74 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  30.34 
 
 
280 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.36 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1667  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.27 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>