31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3738 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  42.39 
 
 
280 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  38.13 
 
 
283 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  35.82 
 
 
284 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  38.35 
 
 
283 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  38.08 
 
 
289 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  36.75 
 
 
284 aa  205  6e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  34.3 
 
 
281 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  35.71 
 
 
286 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  32.74 
 
 
286 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  34.77 
 
 
279 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  30.69 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.23 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.71 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3827  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.32 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.594818  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.36 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0839  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.13 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  25.48 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.32 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.28 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.84 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1854  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.808281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.23 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.12 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  37.04 
 
 
318 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.47 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0159  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.64 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0155  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.46 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1625  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.74 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.386069  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  26.46 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.91 
 
 
293 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>