23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3396 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3396  N-acetylglucosamine kinase  100 
 
 
279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3291  N-acetylglucosamine kinase  47.87 
 
 
286 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.165461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5189  N-acetylglucosamine kinase-like protein  36.79 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3564  hypothetical protein  39.64 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1100  hypothetical protein  39.93 
 
 
283 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.454532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  38.71 
 
 
280 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  36.27 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3738  N-acetylglucosamine kinase  34.77 
 
 
284 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  32.51 
 
 
286 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1626  hypothetical protein  32.74 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4589  N-acetylglucosamine kinase-like protein  28.83 
 
 
283 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3294  hypothetical protein  29.18 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.493511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2705  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  36.7 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0514  hypothetical protein  44.62 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.313056  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0448  hypothetical protein  44.62 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2474  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  39.06 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  43.08 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.87 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.57 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.71 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1358  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.74 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.16 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.05 
 
 
296 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>