87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1887 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1887  N-acetylglucosamine kinase-like protein  100 
 
 
355 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2852  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.72 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34710  predicted N-acetylglucosamine kinase  41.26 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.11671  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3210  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.95 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.817518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0391  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  44.08 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1857  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.96 
 
 
338 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.703313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5375  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  38.06 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.314499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1942  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  41.32 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5376  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  51.92 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.320248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2752  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.86 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5657  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.89 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.28918  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3999  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.82 
 
 
332 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4023  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  43.48 
 
 
382 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0116071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0369  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  37.5 
 
 
340 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0624  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.54 
 
 
296 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.685104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2322  N-acetylglucosamine kinase  46.5 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0958  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.43 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25330  predicted N-acetylglucosamine kinase  30.83 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0261612  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1390  hexokinase  29.1 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.637507  unclonable  0.000000391885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1791  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.93 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.51133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2483  hypothetical protein  25.41 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2257  ATPase family protein  25.41 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.163668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2466  hypothetical protein  31.93 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2294  hypothetical protein  31.93 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2007  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.82 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0254624  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2562  hypothetical protein  28.14 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.516208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3036  hypothetical protein  25.99 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.364678  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1633  N-acetylglucosamine kinase  29.63 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.935257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2501  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  24.78 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.251781  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0371  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.11 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1676  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.62 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2794  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.67 
 
 
314 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0839  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.57 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2273  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  25.41 
 
 
299 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1126  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.49 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2215  ATPase family protein  31.14 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2499  hypothetical protein  30.36 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2845  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.14 
 
 
324 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2421  hypothetical protein  26.41 
 
 
297 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1861  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  21.28 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0296781  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1026  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  29.8 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1312  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.63 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000103615  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2149  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  21.28 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2466  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.73 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.796811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3017  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.75 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00939797  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2909  hypothetical protein  24.67 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.464357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1212  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.32 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000148671  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3114  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.22 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000171707  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2935  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.22 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000122964  normal  0.641945 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3452  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  23.4 
 
 
311 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3353  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.24 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1101  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.25 
 
 
298 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2513  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  35.29 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1076  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.22 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05070  predicted N-acetylglucosamine kinase  35.98 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.629405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2559  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  42.57 
 
 
316 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000106379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1116  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.02 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0080309  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1511  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.73 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3507  hypothetical protein  30.16 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2706  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  28.31 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00102346  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1144  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.14 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000862311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3211  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.14 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1178  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.14 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000024561  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2984  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.04 
 
 
298 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0831  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1084  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  32.14 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0944  hypothetical protein  31.49 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00274123  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1926  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  40.28 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0107  putative Aryl-alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
293 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135343  normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3407  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.65 
 
 
294 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0298  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  31.33 
 
 
327 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1118  hypothetical protein  30.69 
 
 
288 aa  47  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.141712  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1023  hypothetical protein  30.69 
 
 
288 aa  47  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4172  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  33.33 
 
 
293 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6539  N-acetylglucosamine kinase-like protein  30.72 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.404447 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1539  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.27 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1491  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  27.27 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2047  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  34.07 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01900  conserved hypothetical protein  43.08 
 
 
555 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05120  hypothetical protein  27.5 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3064  hypothetical protein  26.67 
 
 
284 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4757  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  29.94 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00859  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.364641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4169  ATPase, BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.78 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0976087  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11050  hypothetical protein  38.46 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.505129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2647  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  26.98 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43955  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5366  ATPase BadF/BadG/BcrA/BcrD type  30.18 
 
 
319 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.374079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>