95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0757 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0761  ankyrin domain-containing protein  76.83 
 
 
818 aa  1315    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0757  ankyrin  100 
 
 
816 aa  1690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0915  ankyrin domain-containing protein  92.03 
 
 
816 aa  1560    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3434  Ankyrin  37.65 
 
 
679 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3287  Ankyrin  37.39 
 
 
678 aa  419  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3433  Ankyrin  30.56 
 
 
716 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.314955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3286  Ankyrin  30.38 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  25.8 
 
 
870 aa  89  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  25.22 
 
 
1585 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  24.84 
 
 
1156 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  23.19 
 
 
1061 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  22.94 
 
 
2413 aa  72  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  20.52 
 
 
1622 aa  70.9  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  22.65 
 
 
750 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  22.98 
 
 
715 aa  65.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  28.34 
 
 
762 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  27.23 
 
 
855 aa  64.7  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  27.27 
 
 
931 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  21.25 
 
 
1021 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  26.34 
 
 
646 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  25.22 
 
 
1402 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  23.83 
 
 
1030 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  23.32 
 
 
479 aa  58.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  27.4 
 
 
345 aa  58.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  30.58 
 
 
163 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  22.76 
 
 
426 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  22.99 
 
 
711 aa  55.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  23.47 
 
 
1005 aa  54.7  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  25.41 
 
 
954 aa  55.1  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  22.89 
 
 
1977 aa  54.3  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 
723 aa  54.7  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  25.29 
 
 
756 aa  53.9  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89724  predicted protein  34.09 
 
 
218 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  29.03 
 
 
581 aa  52.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  25.8 
 
 
305 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1154  ankyrin repeat-containing protein  28.33 
 
 
440 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  33.06 
 
 
190 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  24.09 
 
 
544 aa  52.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  23.66 
 
 
483 aa  52.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  23.44 
 
 
1249 aa  52.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  23.65 
 
 
404 aa  52.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  27.33 
 
 
490 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03513  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
1262 aa  50.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.93447  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3617  Ankyrin  30.43 
 
 
161 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  23.83 
 
 
217 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  26.81 
 
 
278 aa  50.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  23.75 
 
 
427 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  23.38 
 
 
891 aa  49.7  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  24.41 
 
 
790 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  28.03 
 
 
423 aa  48.9  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  22.89 
 
 
821 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.36 
 
 
428 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  22.86 
 
 
542 aa  48.9  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 
1133 aa  48.5  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  25.36 
 
 
342 aa  48.5  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  21.9 
 
 
395 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  26.09 
 
 
178 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  27.34 
 
 
574 aa  47.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  28.1 
 
 
253 aa  47.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  28.07 
 
 
287 aa  47.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  25.75 
 
 
175 aa  47.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3877  Ankyrin  29.82 
 
 
226 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  24.17 
 
 
590 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  23.74 
 
 
196 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  23.74 
 
 
196 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  28.78 
 
 
257 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  20.51 
 
 
865 aa  46.2  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04310  cyclin dependent kinase inhibitor Pho81, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06020)  24.53 
 
 
978 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.298239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  21.13 
 
 
382 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2658  PDZ/DHR/GLGF:ankyrin  27.14 
 
 
1003 aa  46.6  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  28.23 
 
 
640 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  23.3 
 
 
196 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00782  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14510)  25.4 
 
 
1139 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  26.9 
 
 
266 aa  46.2  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  23.74 
 
 
226 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  24.04 
 
 
731 aa  46.2  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  35.96 
 
 
173 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  31.25 
 
 
151 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  25.45 
 
 
210 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
464 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  24.23 
 
 
483 aa  45.8  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  30.7 
 
 
494 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  32.73 
 
 
241 aa  45.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0934  ankyrin  27.71 
 
 
223 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.793859 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2373  Ankyrin  20.5 
 
 
555 aa  45.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000336897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  23.29 
 
 
196 aa  45.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  35.16 
 
 
250 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  26.8 
 
 
442 aa  44.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  22.22 
 
 
431 aa  44.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  32.63 
 
 
347 aa  44.7  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  28.5 
 
 
1116 aa  44.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  24.09 
 
 
236 aa  44.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  33.67 
 
 
737 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  20.32 
 
 
4520 aa  44.3  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  28.89 
 
 
184 aa  44.3  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>