62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3246 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.789189 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3985  hypothetical protein  75.56 
 
 		 225 aa  357  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  31.75 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  30.91 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  29.74 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  33.11 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  33.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  33.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  33.11 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  27.62 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  32.45 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  32.45 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  32.43 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  33.87 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  31.79 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  29.63 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  35.64 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  40.26 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  26.16 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  28.74 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  38.96 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  34.29 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  26.4 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  25.27 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  29.95 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  27.32 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  30 
 
 		 280 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  28.4 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  27.27 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  27.64 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  27.84 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  25.31 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  32.94 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  27.45 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  35.44 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  26.32 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  37 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.67 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  25.95 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  28.93 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  29.07 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  26.63 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  26.16 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  24.83 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  29.41 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  34.19 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  24.02 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  39.51 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  26.86 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  25.58 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  28.3 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  25.58 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  28.66 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  25.27 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  29.61 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  24.02 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  26.86 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>