24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1996 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2225  hypothetical protein  58.33 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0132434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2222  hypothetical protein  54.15 
 
 		 208 aa  241  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2414  hypothetical protein  53.43 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  hitchhiker  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2118  hypothetical protein  49.76 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2017  hypothetical protein  49.76 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000437786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1958  hypothetical protein  50.99 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2209  hypothetical protein  48.31 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000284922  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2353  hypothetical protein  49.04 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4498  hypothetical protein  48.31 
 
 		 207 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2212  hypothetical protein  48.31 
 
 		 207 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00431858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2159  hypothetical protein  48.31 
 
 		 207 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0893912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2225  hypothetical protein  48.31 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000405931  normal  0.0698853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1948  hypothetical protein  46.38 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1802  hypothetical protein  44.09 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2021  hypothetical protein  45.07 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1959  hypothetical protein  43.81 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00145521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1577  hypothetical protein  31.07 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003478  hypothetical protein  25.12 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00496334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02292  hypothetical protein  26.78 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2062  hypothetical protein  23.16 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02067  hypothetical protein  22.86 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0542551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1042  hypothetical protein  25.93 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000234707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1408  hypothetical protein  22.97 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>