21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2017 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000437786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1958  hypothetical protein  94.69 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2353  hypothetical protein  86.47 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4498  hypothetical protein  74.4 
 
 		 207 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2212  hypothetical protein  74.4 
 
 		 207 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00431858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2159  hypothetical protein  74.4 
 
 		 207 aa  316  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0893912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2225  hypothetical protein  73.91 
 
 		 207 aa  314  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000405931  normal  0.0698853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2209  hypothetical protein  73.91 
 
 		 207 aa  314  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000284922  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1948  hypothetical protein  70.05 
 
 		 209 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2414  hypothetical protein  54.41 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  hitchhiker  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2222  hypothetical protein  52.68 
 
 		 208 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2021  hypothetical protein  50.23 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2225  hypothetical protein  53.88 
 
 		 207 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0132434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1996  hypothetical protein  49.76 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1959  hypothetical protein  53.2 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00145521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1802  hypothetical protein  48.66 
 
 		 198 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2062  hypothetical protein  23.72 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02067  hypothetical protein  24.73 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0542551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1577  hypothetical protein  26.34 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02292  hypothetical protein  23.15 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>