23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02067 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02067  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  447  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0542551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2062  hypothetical protein  55.61 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2414  hypothetical protein  28.85 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  hitchhiker  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2225  hypothetical protein  26.73 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0132434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2222  hypothetical protein  25.47 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02292  hypothetical protein  26.29 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1577  hypothetical protein  26.29 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2021  hypothetical protein  23.41 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1996  hypothetical protein  22.86 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0584837  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2353  hypothetical protein  25.26 
 
 
207 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1802  hypothetical protein  25.79 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003478  hypothetical protein  25.58 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00496334  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2118  hypothetical protein  24.73 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.037012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2017  hypothetical protein  24.73 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000437786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2225  hypothetical protein  23.92 
 
 
207 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000405931  normal  0.0698853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2209  hypothetical protein  23.92 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000284922  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2212  hypothetical protein  23.92 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00431858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2159  hypothetical protein  23.92 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0893912  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4498  hypothetical protein  23.92 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1958  hypothetical protein  24.21 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1959  hypothetical protein  22.78 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00145521  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1948  hypothetical protein  28.97 
 
 
209 aa  52  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1042  hypothetical protein  22.05 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000234707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>