16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1042 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1042  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000234707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02292  hypothetical protein  60.91 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003478  hypothetical protein  60.45 
 
 		 220 aa  275  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00496334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1577  hypothetical protein  49.01 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2209  hypothetical protein  25.84 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000284922  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4498  hypothetical protein  25.84 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2212  hypothetical protein  25.84 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00431858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2159  hypothetical protein  25.84 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0893912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1996  hypothetical protein  25.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2225  hypothetical protein  24.18 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000405931  normal  0.0698853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1948  hypothetical protein  26.19 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02067  hypothetical protein  22.54 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0542551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2062  hypothetical protein  22.99 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1802  hypothetical protein  28.03 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1408  hypothetical protein  22.38 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2021  hypothetical protein  23.6 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>