20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003478 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003478  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00496334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02292  hypothetical protein  85.91 
 
 		 220 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1042  hypothetical protein  63.13 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000234707  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1577  hypothetical protein  46.8 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1996  hypothetical protein  25.12 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2414  hypothetical protein  28.5 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  hitchhiker  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02067  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0542551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2225  hypothetical protein  28.02 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0132434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2062  hypothetical protein  21.74 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2209  hypothetical protein  21.95 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000284922  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2159  hypothetical protein  21.95 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0893912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2225  hypothetical protein  21.95 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000405931  normal  0.0698853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2212  hypothetical protein  21.95 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00431858  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4498  hypothetical protein  21.95 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2353  hypothetical protein  22.82 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1959  hypothetical protein  27.98 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00145521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2222  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1802  hypothetical protein  29.01 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2021  hypothetical protein  25.25 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1958  hypothetical protein  25.64 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>