24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2021 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2021  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1959  hypothetical protein  54.84 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00145521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2017  hypothetical protein  50.23 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000437786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2118  hypothetical protein  50.23 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2222  hypothetical protein  50.24 
 
 		 208 aa  218  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1958  hypothetical protein  49.03 
 
 		 207 aa  214  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2414  hypothetical protein  51.71 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  hitchhiker  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2353  hypothetical protein  48.84 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1948  hypothetical protein  49.52 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2225  hypothetical protein  49.3 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0132434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2225  hypothetical protein  46.98 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000405931  normal  0.0698853 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4498  hypothetical protein  46.98 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2212  hypothetical protein  46.98 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00431858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2159  hypothetical protein  46.98 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0893912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2209  hypothetical protein  46.51 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000284922  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1802  hypothetical protein  46.94 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1996  hypothetical protein  45.07 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2062  hypothetical protein  26.88 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02067  hypothetical protein  23.41 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0542551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1577  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1408  hypothetical protein  22.82 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003478  hypothetical protein  25.25 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00496334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1042  hypothetical protein  24.49 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000234707  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02292  hypothetical protein  23.56 
 
 		 220 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>