22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2353 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2353  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2017  hypothetical protein  86.47 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000437786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2118  hypothetical protein  86.47 
 
 		 207 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1958  hypothetical protein  84.54 
 
 		 207 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4498  hypothetical protein  72.46 
 
 		 207 aa  313  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2212  hypothetical protein  72.46 
 
 		 207 aa  313  8e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00431858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2159  hypothetical protein  72.46 
 
 		 207 aa  313  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0893912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2225  hypothetical protein  71.98 
 
 		 207 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000405931  normal  0.0698853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2209  hypothetical protein  71.98 
 
 		 207 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000284922  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1948  hypothetical protein  70.05 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2414  hypothetical protein  54.41 
 
 		 207 aa  224  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  hitchhiker  0.00000180775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2222  hypothetical protein  53.17 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2225  hypothetical protein  54.11 
 
 		 207 aa  218  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0132434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1996  hypothetical protein  49.04 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1959  hypothetical protein  52.97 
 
 		 216 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00145521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2021  hypothetical protein  48.84 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1802  hypothetical protein  45.88 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2062  hypothetical protein  26.05 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02067  hypothetical protein  25.26 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0542551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1577  hypothetical protein  27.43 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003478  hypothetical protein  22.82 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00496334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02292  hypothetical protein  21.84 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>