40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1339 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  80.95 
 
 		 149 aa  254  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  80.95 
 
 		 149 aa  254  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  80.27 
 
 		 149 aa  253  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  80.27 
 
 		 149 aa  253  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  79.05 
 
 		 148 aa  253  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  78.91 
 
 		 149 aa  249  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  79.59 
 
 		 148 aa  248  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  76.87 
 
 		 149 aa  246  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  76.87 
 
 		 149 aa  246  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  75.51 
 
 		 149 aa  245  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  76.19 
 
 		 149 aa  244  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  70.95 
 
 		 148 aa  236  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  84.73 
 
 		 148 aa  233  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  73.83 
 
 		 151 aa  231  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  74.26 
 
 		 148 aa  228  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  52.86 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  50.68 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  51.47 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  39.07 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  50.53 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  41.98 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  41.98 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  47.47 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  46.46 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  44.33 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  40.22 
 
 		 223 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  34.88 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  32.43 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  27.56 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  27.85 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  37.08 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0154  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  36.36 
 
 		 302 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  41.38 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>