34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0322 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  57.5 
 
 		 172 aa  139  9e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  58.82 
 
 		 171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  58.82 
 
 		 171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  58.82 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  55.17 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  55.24 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  48.48 
 
 		 192 aa  94.4  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  29.73 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  28.15 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  26.15 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  27.42 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  25.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  27.91 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  32.58 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  26.56 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  26.56 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  25.53 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  24.22 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  27.36 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  22.06 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  31.03 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  27.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  23.68 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0154  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  37.5 
 
 		 302 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  32.46 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  28.74 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>