16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1265 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  47.06 
 
 
306 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  35.29 
 
 
171 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  40.68 
 
 
223 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  35.29 
 
 
171 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  35.29 
 
 
171 aa  49.7  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  34.21 
 
 
172 aa  49.7  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  43.4 
 
 
178 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  33.7 
 
 
192 aa  46.2  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  41.67 
 
 
177 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  41.94 
 
 
106 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  38.03 
 
 
148 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  43.1 
 
 
133 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  30.07 
 
 
166 aa  43.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  38.81 
 
 
149 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>