38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1591 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  80.41 
 
 		 148 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  82.22 
 
 		 148 aa  239  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  73.83 
 
 		 149 aa  236  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  71.14 
 
 		 149 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  71.14 
 
 		 149 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  71.14 
 
 		 149 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  71.81 
 
 		 149 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  70.47 
 
 		 149 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  69.13 
 
 		 149 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  69.13 
 
 		 149 aa  228  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  69.13 
 
 		 149 aa  228  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  67.57 
 
 		 148 aa  225  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  78.63 
 
 		 148 aa  221  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  66.44 
 
 		 151 aa  215  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  69.12 
 
 		 148 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  51.77 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  49.28 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  47.06 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  38.41 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  43.81 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  38.35 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  39.85 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  43.43 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  42.42 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  40.21 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  35.87 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  34.58 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  36 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  26.15 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  36.25 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  35.9 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  30.17 
 
 		 292 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  37.31 
 
 		 302 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>