38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3785 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  45.45 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  40.78 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  34.91 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  35.14 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  35.14 
 
 
148 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  36.47 
 
 
292 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  41.33 
 
 
149 aa  61.6  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  34.23 
 
 
149 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  34.23 
 
 
149 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  34.23 
 
 
149 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  39.47 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  39.47 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  32.43 
 
 
148 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  38.67 
 
 
148 aa  58.2  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  32.43 
 
 
148 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  37.33 
 
 
148 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  35.37 
 
 
143 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  35.37 
 
 
143 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  34.67 
 
 
145 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  36.36 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  27.59 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  28.87 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  30.21 
 
 
106 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  27.63 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  27.84 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  31.71 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  25.64 
 
 
172 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  18.18 
 
 
171 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  25.58 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  17.05 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  23.68 
 
 
145 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  17.05 
 
 
171 aa  42  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>