35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1798 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  100 
 
 
145 aa  293  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  81.43 
 
 
143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  80 
 
 
143 aa  228  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  62.33 
 
 
144 aa  184  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  45.24 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  45.24 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  41.89 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  45.24 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  45.24 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  45.24 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  45.24 
 
 
149 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  44.44 
 
 
149 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  41.22 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  40.26 
 
 
151 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  44.36 
 
 
161 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  37.33 
 
 
155 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  40.38 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  39.69 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  50.53 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  48.08 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  48.42 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  41.88 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  39.52 
 
 
148 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  42.57 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  42.57 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  44.57 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  33.85 
 
 
178 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  34.67 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  29.47 
 
 
223 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  36.25 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  30.1 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  30.1 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  30.1 
 
 
171 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  28.71 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  32.56 
 
 
166 aa  40  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>