36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3256 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  306  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  94.63 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  94.63 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  93.96 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  93.29 
 
 		 149 aa  293  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  93.29 
 
 		 149 aa  293  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  92.62 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  92.62 
 
 		 149 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  85.91 
 
 		 149 aa  277  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  74.5 
 
 		 148 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  72.11 
 
 		 148 aa  239  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  75.51 
 
 		 148 aa  235  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  71.81 
 
 		 148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  76.47 
 
 		 148 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  70.2 
 
 		 151 aa  226  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  75.57 
 
 		 148 aa  215  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  53.9 
 
 		 161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  48.32 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  54.2 
 
 		 155 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  38.24 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  40.6 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  39.85 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  49.47 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  43.4 
 
 		 177 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  42.45 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  40.59 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  40.82 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  40 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  33.04 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  30.17 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  34.74 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  25.78 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  37.31 
 
 		 302 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>