37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1323 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  99.33 
 
 
149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  94.63 
 
 
149 aa  298  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  91.28 
 
 
149 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  91.28 
 
 
149 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  91.28 
 
 
149 aa  289  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  90.6 
 
 
149 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  84.56 
 
 
149 aa  274  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  73.83 
 
 
148 aa  241  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  72.79 
 
 
148 aa  240  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  76.87 
 
 
148 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  75.74 
 
 
148 aa  229  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  70.2 
 
 
151 aa  228  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  69.13 
 
 
148 aa  228  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  75.57 
 
 
148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  53.9 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  50.34 
 
 
155 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  54.96 
 
 
155 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  44.62 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  43.85 
 
 
143 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  41.18 
 
 
144 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  50.53 
 
 
145 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  44.66 
 
 
177 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  43.69 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  40.59 
 
 
106 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  43.69 
 
 
223 aa  77  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  44.29 
 
 
178 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  30.17 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  26.56 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  32.43 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  32.63 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  32.63 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  32.63 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  28.08 
 
 
292 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  37.5 
 
 
302 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>