37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1151 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  75 
 
 		 148 aa  243  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  76.55 
 
 		 149 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  74.15 
 
 		 149 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  74.83 
 
 		 149 aa  240  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  74.83 
 
 		 149 aa  240  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  74.83 
 
 		 149 aa  240  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  74.15 
 
 		 149 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  72.79 
 
 		 149 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  72.79 
 
 		 149 aa  238  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  72.11 
 
 		 149 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  74.81 
 
 		 148 aa  228  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  66.89 
 
 		 148 aa  227  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  65.54 
 
 		 148 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  69.44 
 
 		 151 aa  218  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  68.92 
 
 		 148 aa  215  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  50.34 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  49.32 
 
 		 155 aa  153  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  52.67 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  41.48 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  46.32 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  38.35 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  38.52 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  43.43 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  42.42 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  41.24 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  35.14 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  29.36 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  28.81 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  30 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  29.81 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 171 aa  43.9  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  32.73 
 
 		 292 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>