41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1482 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  460  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  34.42 
 
 
177 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  40.78 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  43.62 
 
 
106 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  40.2 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  38.46 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  42.71 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  42.71 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  42.71 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  43.69 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  41.67 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  43.69 
 
 
149 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  43.69 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  42.39 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  39.33 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  40.22 
 
 
148 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  39.58 
 
 
149 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  40.22 
 
 
148 aa  72  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  36.26 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  38.04 
 
 
148 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  36.96 
 
 
148 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  35.87 
 
 
148 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  34 
 
 
292 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  35.8 
 
 
155 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  31.34 
 
 
161 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  32.61 
 
 
143 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  32.63 
 
 
144 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  25.49 
 
 
192 aa  55.5  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  31.52 
 
 
143 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  29.47 
 
 
145 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  29.59 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  26.56 
 
 
171 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  40.68 
 
 
302 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  26.4 
 
 
166 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  26.56 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  32.58 
 
 
145 aa  48.9  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  26.04 
 
 
171 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  40 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2382  protein of unknown function DUF400  41.07 
 
 
316 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.283039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>