37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1461 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  100 
 
 		 161 aa  324  3e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  60.47 
 
 		 171 aa  207  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  59.88 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  59.88 
 
 		 171 aa  204  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  57.56 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  54.6 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  55.17 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  46.53 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  35.05 
 
 		 292 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  31.34 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  32.99 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  30.17 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  27.59 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  30.17 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  30.17 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  30.17 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  35.37 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  27.93 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  26.32 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  36.05 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  28.81 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  27.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  32.18 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  29.67 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  31.88 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  26.19 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  23.68 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  23.85 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  28.69 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  30.26 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  34.67 
 
 		 106 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  28.71 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>