37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1619 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  85.85 
 
 
133 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  85.85 
 
 
177 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  44.33 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  42.27 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  42.27 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  42.27 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  46.74 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  40.59 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  42.27 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  41.24 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  40.59 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  40.59 
 
 
149 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  40.21 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  43.3 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  43.62 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  39.6 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  40.21 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  41.24 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  38.04 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  45.65 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  41.3 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  45.65 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  44.57 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  38.04 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  33.02 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  35.42 
 
 
292 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  38.46 
 
 
178 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  30.21 
 
 
209 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  39.73 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  39.44 
 
 
306 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  41.94 
 
 
302 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  31.76 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  31.76 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  31.76 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  34.67 
 
 
161 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>