65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28090 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28090  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0043  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer03  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000286931  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0049  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0038  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0047  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.047697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12770  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0056  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000159077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0058  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2643  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0810  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0309716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2954  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3020  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.419002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0059  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.813738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1969  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.156913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3054  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0038  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1581  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0045  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.331692  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  85.19 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0041  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0027  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2775  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0559618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0045  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1128  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.93394e-25 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1195  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1150  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.14508  normal  0.321314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1045  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.395551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1162  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.520358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1206  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0026  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.580647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0052  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000218477  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4306  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0040  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000505544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0064  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0414  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0040  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0721486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0010  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2147  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.478396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0070  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00023  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0042  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.760649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4663  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000383735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5026  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0065  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0269499  hitchhiker  0.0000672663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>