95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2514 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2514  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  42.35 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1182  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  38.76 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0707578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2306  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  37.16 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00564306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2632  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  34.48 
 
 		 344 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1839  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.63 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.865717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22120  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  36.12 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1484  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.85 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5892  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.87 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0406172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  36.4 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2005  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.47 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2243  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  37.12 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.834026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20910  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  35.61 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.25 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  36.54 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12150  RNA methyltransferase  34.98 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  36.23 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2457  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.87 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1915  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  35.47 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000210354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2638  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  34.96 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1200  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  35.09 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0440767  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2416  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.33 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2172  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  34.72 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00868355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16210  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  34.09 
 
 		 359 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0743414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3462  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  37.11 
 
 		 296 aa  162  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11850  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  34.33 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00898867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  32.95 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3148  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.36 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3198  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.36 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3136  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.36 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2152  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.98 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2355  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  35.88 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805289  normal  0.143216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3065  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0788326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.46 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.78 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.85 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1485  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.69 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130209  normal  0.405795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0539  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  35.6 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000466201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2238  hypothetical protein  35.88 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1857  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.32 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0203  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  34.91 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1481  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.25 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000220785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0620  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.49 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1298  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.29 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.84093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  36.29 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  32.51 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.8 
 
 		 262 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.4 
 
 		 262 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  33.58 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.48 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.54 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0685  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.04 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.727075  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.25 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  30.45 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.07 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.68 
 
 		 253 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  35.48 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  31.4 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1224  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  35.64 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0607  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.99 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0690  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.23 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  37.04 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0209  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.26 
 
 		 237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1401  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  26.91 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16240  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.47 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  34.4 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2288  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.19 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00198385  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3687  predicted protein  30.86 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0625278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2535  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.44 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0823  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  32.42 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0358944 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1367  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.13 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  27.82 
 
 		 244 aa  95.9  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  27.06 
 
 		 250 aa  95.5  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  25.82 
 
 		 241 aa  92.8  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0923  beta-aspartate methyltransferase  27.84 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1687  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  28.17 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0354  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.93 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000362524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1831  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  26.21 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  25.3 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01430  hypothetical protein  31.46 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00362706  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  23.31 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  24.7 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  28.35 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65994  translational repressor of GCN4  25.1 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08799  tRNA methyltransferase subunit GCD14, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09620)  28.16 
 
 		 502 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675842 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.1 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.811474  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  24.02 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  40.85 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1045  dimethyladenosine transferase  43.06 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46051  normal  0.898913 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1135  hypothetical protein  28.21 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.448713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>