95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2632 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2632  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  100 
 
 		 344 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  80.46 
 
 		 358 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2416  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  70.71 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1200  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  63.32 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0440767  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2355  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  65.57 
 
 		 326 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805289  normal  0.143216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1857  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  64.98 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1485  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  67.86 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130209  normal  0.405795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2005  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  63.41 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20910  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  66.32 
 
 		 349 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2238  hypothetical protein  68.89 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1839  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  68.98 
 
 		 296 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.865717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2306  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  65.78 
 
 		 305 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00564306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5892  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  69.09 
 
 		 289 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0406172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2638  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  66.07 
 
 		 316 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  66.06 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  66.55 
 
 		 298 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1484  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  64.21 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2172  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  61.13 
 
 		 355 aa  364  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00868355  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1915  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  64.31 
 
 		 354 aa  360  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000210354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2243  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  68.31 
 
 		 342 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.834026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  64.94 
 
 		 275 aa  359  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  67.9 
 
 		 296 aa  358  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1182  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  69 
 
 		 293 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0707578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  63.54 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2152  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  63.1 
 
 		 275 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2457  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  65.07 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22120  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  67.31 
 
 		 273 aa  342  8e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16210  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  59.86 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0743414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11850  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  56.27 
 
 		 354 aa  331  9e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00898867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3462  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  61.99 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3065  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  61.07 
 
 		 288 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0788326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3148  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  60.65 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3198  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  60.65 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3136  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  60.65 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12150  RNA methyltransferase  62.5 
 
 		 280 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  41.88 
 
 		 383 aa  249  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  44.4 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  40.06 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  44.92 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1481  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  41.18 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000220785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2514  SAM-dependent methyltransferase  34.48 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  41.73 
 
 		 296 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.93 
 
 		 281 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  36.8 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  36.82 
 
 		 266 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.54 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.14 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.38 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.72 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  30.65 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0203  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  30.88 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0201025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.14 
 
 		 277 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1298  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.1 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.84093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  34.52 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0620  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.53 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  36.76 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0209  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  35.48 
 
 		 237 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.13 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.38 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0539  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  31.73 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000466201  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0607  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.38 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  32.53 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.85 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16240  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.47 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.02 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0685  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.33 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.727075  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0823  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  32.3 
 
 		 254 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0358944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1224  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.83 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2288  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  37.17 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00198385  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1401  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.63 
 
 		 256 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468814  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0923  beta-aspartate methyltransferase  33.71 
 
 		 254 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1367  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.42 
 
 		 254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  33.71 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0690  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.75 
 
 		 293 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  31.56 
 
 		 250 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0354  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.81 
 
 		 252 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000362524  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01430  hypothetical protein  27.5 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00362706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  32.99 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3687  predicted protein  25.61 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0625278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.07 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  31.25 
 
 		 244 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.29 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.811474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2535  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.46 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  25.34 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65994  translational repressor of GCN4  25 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1687  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1831  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  26.88 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  25.38 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  26.03 
 
 		 244 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1699  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  27.59 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  31.03 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0051  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  52.17 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08799  tRNA methyltransferase subunit GCD14, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09620)  23.36 
 
 		 502 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>