98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2638 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2638  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  100 
 
 
316 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2416  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  65.02 
 
 
330 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1857  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  65.33 
 
 
363 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2632  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  66.07 
 
 
344 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20910  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  61.54 
 
 
349 aa  363  2e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  61.69 
 
 
298 aa  358  7e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2306  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  65.34 
 
 
305 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00564306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1485  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  60.68 
 
 
354 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130209  normal  0.405795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2005  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  61.95 
 
 
349 aa  354  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5892  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  64.31 
 
 
289 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0406172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1200  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  62.19 
 
 
341 aa  352  4e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0440767  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  61.51 
 
 
358 aa  352  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  61.2 
 
 
363 aa  350  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1839  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  65.14 
 
 
296 aa  350  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.865717  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1484  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  59.93 
 
 
334 aa  345  5e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2355  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  59.66 
 
 
326 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805289  normal  0.143216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2172  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  56.25 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00868355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2243  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  63.48 
 
 
342 aa  335  7.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.834026  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2238  hypothetical protein  60.95 
 
 
318 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1915  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  55.44 
 
 
354 aa  329  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000210354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.8 
 
 
294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11850  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  60.65 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00898867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16210  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  58.87 
 
 
359 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0743414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  60.22 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1182  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  61.36 
 
 
293 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0707578  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  59.35 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2152  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.01 
 
 
275 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3462  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.76 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2457  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  59.86 
 
 
276 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22120  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  60.75 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3065  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  57.14 
 
 
288 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0788326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12150  RNA methyltransferase  58.12 
 
 
280 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3136  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.93 
 
 
284 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3148  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.93 
 
 
284 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3198  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.93 
 
 
284 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  45.69 
 
 
284 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  42.62 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  44.06 
 
 
263 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  40.07 
 
 
383 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2514  SAM-dependent methyltransferase  34.96 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  37.84 
 
 
277 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1481  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  38.17 
 
 
286 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000220785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  36.16 
 
 
266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  38.32 
 
 
296 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.71 
 
 
281 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0620  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.33 
 
 
290 aa  142  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1298  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.62 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.84093  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  35 
 
 
255 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0203  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  32.57 
 
 
290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0201025  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  34.54 
 
 
253 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.65 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.82 
 
 
262 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  30.92 
 
 
253 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.44 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  34.91 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.18 
 
 
282 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  34.12 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.57 
 
 
298 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0685  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.56 
 
 
285 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.727075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.83 
 
 
279 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  30.2 
 
 
277 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.09 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0539  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  31.91 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000466201  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0209  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.5 
 
 
237 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16240  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.62 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1224  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.87 
 
 
267 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2288  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  35.27 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00198385  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1401  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.35 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468814  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0823  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  29.92 
 
 
254 aa  110  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0358944 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0607  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.45 
 
 
291 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1367  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.66 
 
 
254 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0923  beta-aspartate methyltransferase  31.42 
 
 
254 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0690  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.75 
 
 
293 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  32.58 
 
 
255 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01430  hypothetical protein  29.83 
 
 
433 aa  92.4  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00362706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  28.35 
 
 
250 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  29.5 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3687  predicted protein  25.73 
 
 
239 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0625278  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0354  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.55 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000362524  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65994  translational repressor of GCN4  24.8 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2535  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.28 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.8 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.811474  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  31.77 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  25.54 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  29.55 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1831  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  24.71 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  30.05 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.97 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1687  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  25.53 
 
 
241 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  24.26 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08799  tRNA methyltransferase subunit GCD14, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09620)  24.3 
 
 
502 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
278 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0051  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  43.86 
 
 
412 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1699  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  28.78 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0931  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  35.59 
 
 
423 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2801  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.81 
 
 
398 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>