94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1484 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1484  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  100 
 
 		 334 aa  671    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20910  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  73.54 
 
 		 349 aa  494  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2005  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  73.21 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1200  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  71.43 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0440767  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1915  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  66.46 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000210354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1857  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  64.64 
 
 		 363 aa  435  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2172  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  67.81 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00868355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2243  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  72.88 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.834026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  63.16 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2416  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  68.24 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11850  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  63.38 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00898867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16210  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  59.52 
 
 		 359 aa  371  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0743414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2632  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  64.21 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  64.55 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1485  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  62.5 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130209  normal  0.405795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  59.59 
 
 		 294 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2306  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  64.29 
 
 		 305 aa  349  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00564306  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2638  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  59.93 
 
 		 316 aa  345  5e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2355  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  61.4 
 
 		 326 aa  345  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805289  normal  0.143216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  59.38 
 
 		 298 aa  345  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5892  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  62.5 
 
 		 289 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0406172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1839  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  61.43 
 
 		 296 aa  340  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.865717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2238  hypothetical protein  60.29 
 
 		 318 aa  328  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  59.06 
 
 		 275 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.54 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2152  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  59.42 
 
 		 275 aa  315  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1182  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  59.85 
 
 		 293 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0707578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2457  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.7 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22120  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  60.23 
 
 		 273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3136  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.94 
 
 		 284 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3148  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.94 
 
 		 284 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3198  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.94 
 
 		 284 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3065  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  57.75 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0788326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3462  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.33 
 
 		 275 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12150  RNA methyltransferase  54.74 
 
 		 280 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  41.41 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  43.23 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  41.22 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  41.7 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2514  SAM-dependent methyltransferase  34.85 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  40.45 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1481  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  36.92 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000220785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.02 
 
 		 277 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.53 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  33.98 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0539  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  32.16 
 
 		 306 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000466201  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.42 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  33.6 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  30.42 
 
 		 282 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.28 
 
 		 302 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.57 
 
 		 262 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.95 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  30.04 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.19 
 
 		 262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0209  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.8 
 
 		 237 aa  116  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  33.19 
 
 		 254 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1367  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.17 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.46 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  31.75 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0620  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.67 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1298  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.39 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.84093  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0203  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  29.03 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0201025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  29.5 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2288  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.18 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00198385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1224  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.1 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1401  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.08 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468814  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  35.27 
 
 		 255 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.04 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0823  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  32.24 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0358944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0685  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.05 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.727075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0690  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.75 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0923  beta-aspartate methyltransferase  31.25 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16240  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.04 
 
 		 255 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0607  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.57 
 
 		 291 aa  95.9  9e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3687  predicted protein  27.88 
 
 		 239 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0625278  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0354  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  25.71 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000362524  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01430  hypothetical protein  28.34 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00362706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  25.65 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  28.99 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2535  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.44 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1831  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  25.68 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65994  translational repressor of GCN4  23.34 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  29.41 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  23.63 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  23.92 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  23.86 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.15 
 
 		 243 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.811474  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1687  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  25.11 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  25.76 
 
 		 244 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2101  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0598  O-methyltransferase family protein  30.38 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.54088  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08799  tRNA methyltransferase subunit GCD14, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09620)  35 
 
 		 502 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>