79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3177 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3177  NTPase  100 
 
 		 190 aa  393  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0756  NTPase  70.88 
 
 		 180 aa  269  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0857  NTPase  63.74 
 
 		 189 aa  249  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0738  NTPase  62.43 
 
 		 205 aa  244  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3918  NTPase  61.88 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.472374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  61.45 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  61.8 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2245  NTPase  60.89 
 
 		 186 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  61.24 
 
 		 184 aa  222  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  62.36 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  58.99 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  62.36 
 
 		 186 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  61.11 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  62.36 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  62.36 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  61.8 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  55.87 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03969  NTPase  54.7 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004399  hypothetical protein  47.49 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0660  NTPase  46.67 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0232  NTPase  47.16 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01000  NTPase  46.37 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3675  NTPase  39.53 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3869  NTPase  39.53 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000951623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0566  NTPase  40.46 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4993  NTPase  39.31 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4942  NTPase  39.31 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4630  NTPase  39.31 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3662  NTPase  39.31 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5909  NTPase  39.31 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04270  NTPase  39.31 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4944  NTPase  39.31 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3603  protein of unknown function DUF84  39.31 
 
 		 170 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0555  NTPase  39.31 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04235  hypothetical protein  39.31 
 
 		 169 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0527  NTPase  39.31 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4942  NTPase  39.88 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4994  NTPase  39.88 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4908  NTPase  39.88 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4996  NTPase  39.88 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3611  NTPase  39.53 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3483  NTPase  39.53 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4835  NTPase  39.31 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0816  NTPase  38.95 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0677  NTPase  36.05 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152627  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0682  hypothetical protein  34.48 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0772299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0603  protein of unknown function DUF84  35.82 
 
 		 197 aa  95.9  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2804  protein of unknown function DUF84  35.29 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  35.52 
 
 		 320 aa  94.7  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1630  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0837  protein of unknown function DUF84  33.14 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0050  protein of unknown function DUF84  35 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0688  NTPase  31.14 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0778  hypothetical protein  33.14 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.108988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2744  NTPase  30.99 
 
 		 172 aa  84.7  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000885724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2722  hypothetical protein  29.94 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.754344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3356  NTPase  29.14 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1629  protein of unknown function DUF84  29.65 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4590  NTPase  28.32 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000478498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4946  NTPase  28.32 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4526  NTPase  29.14 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323237  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0520  hypothetical protein  31.58 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0429  NTPase  28.32 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1248  hypothetical protein  31.18 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.31896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4812  NTPase  27.75 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4445  NTPase  27.75 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4427  NTPase  27.75 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1388  hypothetical protein  30.41 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4828  NTPase  27.75 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0201611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4807  NTPase  26.59 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4837  NTPase  27.75 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1377  hypothetical protein  28.65 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1309  hypothetical protein  28.07 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0543493  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1392  hypothetical protein  29.12 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0541  protein of unknown function DUF84  32.02 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.393243  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0122  hypothetical protein  25.14 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1315  hypothetical protein  25.14 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.48293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0872  hypothetical protein  25.14 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1859  hypothetical protein  25.82 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>