75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0541 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0541  protein of unknown function DUF84  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.393243  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1309  hypothetical protein  35.71 
 
 
216 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0543493  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0872  hypothetical protein  37.5 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1377  hypothetical protein  31.95 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1388  hypothetical protein  29.59 
 
 
219 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0520  hypothetical protein  30.18 
 
 
219 aa  88.2  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1630  hypothetical protein  34.5 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1248  hypothetical protein  29.17 
 
 
219 aa  85.9  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.31896  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1392  hypothetical protein  36.26 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1315  hypothetical protein  37.79 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.48293 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  35.67 
 
 
320 aa  77.8  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1859  hypothetical protein  37.87 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0682  hypothetical protein  37.87 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0772299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0837  protein of unknown function DUF84  35.88 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0122  hypothetical protein  32.54 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2804  protein of unknown function DUF84  33.33 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01000  NTPase  31.18 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0660  NTPase  30.95 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0603  protein of unknown function DUF84  36.88 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2744  NTPase  30.3 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000885724  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004399  hypothetical protein  30.81 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2722  hypothetical protein  36.31 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.754344  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  31.29 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4526  NTPase  30.19 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0429  NTPase  30.19 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4942  NTPase  30.54 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4807  NTPase  30.19 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4946  NTPase  30.19 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4590  NTPase  30.19 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000478498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4944  NTPase  30.72 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3662  NTPase  30.72 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04235  hypothetical protein  30.72 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4993  NTPase  30.72 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4630  NTPase  30.72 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3603  protein of unknown function DUF84  30.72 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04270  NTPase  30.72 
 
 
173 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4812  NTPase  30 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3356  NTPase  30.77 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0688  NTPase  32.47 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0232  NTPase  31.21 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5909  NTPase  30.12 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4837  NTPase  30.19 
 
 
169 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0778  hypothetical protein  30.36 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.108988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  31.33 
 
 
179 aa  54.3  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4445  NTPase  29.38 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4427  NTPase  29.38 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3177  NTPase  32.02 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4828  NTPase  30 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0201611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2245  NTPase  32.78 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0738  NTPase  31.18 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4835  NTPase  30.12 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  30.11 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4908  NTPase  30.12 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4996  NTPase  30.12 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0555  NTPase  31.33 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4942  NTPase  30.12 
 
 
171 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643685  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4994  NTPase  30.12 
 
 
171 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  31.43 
 
 
179 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0756  NTPase  31.98 
 
 
180 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0857  NTPase  28.32 
 
 
189 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03969  NTPase  29.38 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  27.98 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3918  NTPase  28.82 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.472374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  30.23 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  29.65 
 
 
186 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  29.65 
 
 
186 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0527  NTPase  30.54 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0050  protein of unknown function DUF84  26.04 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1629  protein of unknown function DUF84  32.57 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3869  NTPase  28.92 
 
 
179 aa  44.7  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000951623  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  30.72 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  30.72 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3675  NTPase  28.92 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  30.72 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0566  NTPase  29.76 
 
 
179 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>