77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0859 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  100 
 
 
184 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  86.34 
 
 
186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  85.79 
 
 
186 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  85.25 
 
 
186 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  78.26 
 
 
179 aa  295  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  81.97 
 
 
179 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  81.42 
 
 
179 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  80.87 
 
 
179 aa  286  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  67.03 
 
 
179 aa  251  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0738  NTPase  67.21 
 
 
205 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0857  NTPase  64.61 
 
 
189 aa  239  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3918  NTPase  62.36 
 
 
198 aa  237  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.472374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0756  NTPase  66.09 
 
 
180 aa  228  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3177  NTPase  61.24 
 
 
190 aa  228  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  63.48 
 
 
187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2245  NTPase  57.78 
 
 
186 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  54.19 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03969  NTPase  55.68 
 
 
193 aa  194  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0232  NTPase  47.46 
 
 
174 aa  158  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0660  NTPase  45.71 
 
 
173 aa  150  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004399  hypothetical protein  46.24 
 
 
177 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01000  NTPase  45.4 
 
 
183 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3869  NTPase  39.64 
 
 
179 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000951623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3675  NTPase  39.05 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0555  NTPase  38.95 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4993  NTPase  37.85 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4630  NTPase  37.85 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3603  protein of unknown function DUF84  37.85 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04270  NTPase  37.85 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4944  NTPase  37.85 
 
 
174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3662  NTPase  37.85 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4942  NTPase  37.85 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5909  NTPase  37.85 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0566  NTPase  39.05 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0527  NTPase  38.46 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04235  hypothetical protein  37.57 
 
 
169 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3611  NTPase  38.1 
 
 
180 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0816  NTPase  37.5 
 
 
180 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4942  NTPase  37.79 
 
 
171 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643685  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3483  NTPase  37.5 
 
 
180 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4994  NTPase  37.79 
 
 
171 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4908  NTPase  37.79 
 
 
171 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4996  NTPase  37.79 
 
 
171 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4835  NTPase  37.21 
 
 
171 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0677  NTPase  34.91 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152627  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0682  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0772299 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2804  protein of unknown function DUF84  32.8 
 
 
190 aa  88.2  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0050  protein of unknown function DUF84  36.11 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2744  NTPase  32.16 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000885724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4812  NTPase  31.21 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3356  NTPase  31.79 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4427  NTPase  31.21 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4445  NTPase  31.21 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275001  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0603  protein of unknown function DUF84  31 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2722  hypothetical protein  31.07 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.754344  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4828  NTPase  31.21 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0201611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0429  NTPase  31.21 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4946  NTPase  31.21 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4590  NTPase  31.21 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000478498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0688  NTPase  29.82 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0894  cytidyltransferase-related domain protein  30.77 
 
 
320 aa  77.8  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4837  NTPase  30.64 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4807  NTPase  30.64 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4526  NTPase  30.06 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0837  protein of unknown function DUF84  31.43 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1629  protein of unknown function DUF84  28.18 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1630  hypothetical protein  31.11 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1388  hypothetical protein  28.4 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.947437  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1248  hypothetical protein  28.4 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.31896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0520  hypothetical protein  28.99 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0778  hypothetical protein  30.77 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.108988 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1309  hypothetical protein  27.22 
 
 
216 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0543493  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1377  hypothetical protein  27.98 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0541  protein of unknown function DUF84  30.11 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.393243  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0122  hypothetical protein  27.91 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1392  hypothetical protein  27.43 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1315  hypothetical protein  23.3 
 
 
178 aa  41.2  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.48293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>